Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Clec18aQ7TSQ1 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Clec18aQ7TSQ1 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Clec18aQ7TSQ1 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms