Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ppp6r1Q7TSI3 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Krtap13-201ENSMUST00000053149 882 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ppp6r1Q7TSI3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ppp6r1Q7TSI3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ppp6r1Q7TSI3 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm7714-201ENSMUST00000169154 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ppp6r1Q7TSI3 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ppp6r1Q7TSI3 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ppp6r1Q7TSI3 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ppp6r1Q7TSI3 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ppp6r1Q7TSI3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ppp6r1Q7TSI3 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ppp6r1Q7TSI3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ppp6r1Q7TSI3 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ppp6r1Q7TSI3 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ppp6r1Q7TSI3 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ppp6r1Q7TSI3 Gm26653-201ENSMUST00000181537 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ppp6r1Q7TSI3 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms