Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm37622-201ENSMUST00000192162 285 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm32856-202ENSMUST00000212180 1134 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Daam2-201ENSMUST00000057610 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Tmem35b-202ENSMUST00000106097 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm14817-201ENSMUST00000148522 643 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Cd24a-202ENSMUST00000214476 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
NipblQ6KCD5 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms