Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Xrcc1Q60596 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms