Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm27Q5SFM8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms