Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Trp53i11Q4QQM4 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Trp53i11Q4QQM4 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms