Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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Syne3Q4FZC9 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Syne3Q4FZC9 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Syne3Q4FZC9 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Syne3Q4FZC9 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Syne3Q4FZC9 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Syne3Q4FZC9 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Syne3Q4FZC9 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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