Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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D13Ertd608eQ3UPR8 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
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D13Ertd608eQ3UPR8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
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D13Ertd608eQ3UPR8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nktr-201ENSMUST00000035112 7022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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D13Ertd608eQ3UPR8 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekha7-206ENSMUST00000182487 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
D13Ertd608eQ3UPR8 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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