Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hdgfl2Q3UMU9 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdgfl2Q3UMU9 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms