Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gtpbp6Q3U6U5 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gtpbp6Q3U6U5 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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