Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Glrb-206ENSMUST00000194085 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Ctsll3-201ENSMUST00000043754 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rpusd2Q149F1 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Rpusd2Q149F1 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Rpusd2Q149F1 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Rpusd2Q149F1 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Rpusd2Q149F1 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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