Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 C2-206ENSMUST00000152417 2157 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Ttc39dQ0VF76 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms