Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Col9a2Q07643 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms