Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm43322-201ENSMUST00000196232 1612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Ube2uos-201ENSMUST00000142634 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm8826-201ENSMUST00000193161 948 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm18024-201ENSMUST00000218516 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 CT009494.1-201ENSMUST00000225121 1213 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm9788-201ENSMUST00000057038 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Olfr948-201ENSMUST00000076516 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm32255-201ENSMUST00000219456 1349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm19224-201ENSMUST00000190477 793 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm43802-201ENSMUST00000197826 637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sox12Q04890 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms