Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

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Length 1,239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Ctcflos-203ENSMUST00000144256 1237 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Grin2cQ01098 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 1700031M16Rik-205ENSMUST00000189907 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Grin2cQ01098 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm7714-201ENSMUST00000169154 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Grin2cQ01098 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms