Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 4932442E05Rik-201ENSMUST00000191892 2717 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Atg13-202ENSMUST00000076803 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Bbs9-209ENSMUST00000147405 3045 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Trim69-201ENSMUST00000036089 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Spns3-201ENSMUST00000021154 1804 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Polr2iP60898 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms