Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gp1bbP56400 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms