Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Havcr1-202ENSMUST00000081819 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Pip5k1a-201ENSMUST00000005768 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 AC121793.2-201ENSMUST00000217127 2728 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Irf2-201ENSMUST00000034041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Exoc3l4-210ENSMUST00000223050 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Ralgps2-202ENSMUST00000063199 2947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sh3bp1P55194 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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