Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm12498-201ENSMUST00000138374 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ctsa-202ENSMUST00000103092 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Ahrr-202ENSMUST00000109640 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Aqp4P55088 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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Aqp4P55088 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm45867-201ENSMUST00000208201 2317 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 5830462I19Rik-201ENSMUST00000168137 3383 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Aqp4P55088 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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