Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm15597-201ENSMUST00000145924 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm29436-202ENSMUST00000189054 1172 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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LtbrP50284 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm17838-201ENSMUST00000205872 876 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
LtbrP50284 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms