Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
SrprbP47758 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Gm21142-201ENSMUST00000179999 2604 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
SrprbP47758 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms