Protein–RNA interactions for Protein: P47708

Rph3a, Rabphilin-3A, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3aP47708 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rph3aP47708 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rph3aP47708 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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