Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Hoxc11P31313 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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