Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Cd28P31041 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Epb41-202ENSMUST00000054917 4948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cd28P31041 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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