Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 H2afb2-201ENSMUST00000118616 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Glns-ps1-201ENSMUST00000120291 1118 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Rsl24d1-203ENSMUST00000165177 597 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Pttg1-201ENSMUST00000020685 634 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm18857-201ENSMUST00000210421 901 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm35696-202ENSMUST00000220364 778 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm19001-201ENSMUST00000222736 1651 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Tbxas1-206ENSMUST00000162521 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gstm6-204ENSMUST00000106684 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Samd13-201ENSMUST00000124931 905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm9458-201ENSMUST00000135273 727 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 1700084F23Rik-201ENSMUST00000186662 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm43821-201ENSMUST00000199198 729 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm6457-201ENSMUST00000066378 815 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 n-R5s25-201ENSMUST00000082923 119 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Cox7a1-201ENSMUST00000098594 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm43165-201ENSMUST00000200842 1635 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Mrps18b-202ENSMUST00000113782 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Hsd17b13-203ENSMUST00000120320 1118 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm12464-201ENSMUST00000121385 1016 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 A530010F05Rik-201ENSMUST00000146845 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Rsrc1-209ENSMUST00000162693 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm32567-201ENSMUST00000211244 682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm15383-201ENSMUST00000121889 1443 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm14983-201ENSMUST00000121551 323 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm7847-201ENSMUST00000151645 777 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Olfr754-ps1-201ENSMUST00000173181 911 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm7251-201ENSMUST00000182661 1009 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm34780-201ENSMUST00000193896 949 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm44017-201ENSMUST00000203231 740 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 A930033M14Rik-201ENSMUST00000217206 400 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm40578-202ENSMUST00000221429 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 AC167019.2-201ENSMUST00000227335 845 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PtprmP28828 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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