Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RxraP28700 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Adat1-201ENSMUST00000034427 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
RxraP28700 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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