Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Aagab-201ENSMUST00000041551 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm38245-201ENSMUST00000191702 2621 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Eya3-202ENSMUST00000079157 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Svep1-201ENSMUST00000042850 11629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Clip1-201ENSMUST00000031382 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Smc2-201ENSMUST00000102915 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 AC153370.2-201ENSMUST00000217920 3093 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Rreb1-201ENSMUST00000037232 8395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ilf3-204ENSMUST00000213603 3430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 AC132467.2-201ENSMUST00000226306 2253 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Kalrn-212ENSMUST00000114973 5253 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ubr5-204ENSMUST00000226414 8397 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Map2-206ENSMUST00000114017 4981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Dlg2-201ENSMUST00000074273 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Vpreb1P13372 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms