Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Dpm1-202ENSMUST00000109193 1076 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Milr1-203ENSMUST00000147326 1234 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Rergl-201ENSMUST00000170650 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Obox1-205ENSMUST00000173443 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Obox2-204ENSMUST00000174305 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 AC167222.1-201ENSMUST00000219379 660 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Ttll1-202ENSMUST00000109479 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Hoxb4P10284 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms