Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ahrr-201ENSMUST00000022059 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 4930589P08Rik-201ENSMUST00000129097 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Nme6-206ENSMUST00000197627 905 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
H2-Eb1P04230 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm37697-201ENSMUST00000195680 1844 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
H2-Eb1P04230 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms