Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Tgfb1P04202 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Tgfb1P04202 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Adam3-210ENSMUST00000171611 1202 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
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Tgfb1P04202 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tgfb1P04202 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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