Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Efna1-203ENSMUST00000118860 1403 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01645 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01645 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01645 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01645 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01645 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01645 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Cpsf4l-201ENSMUST00000018871 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm28505-201ENSMUST00000190466 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm37944-201ENSMUST00000194233 414 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01645 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms