Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Ccl20O89093 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms