Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Sp100O35892 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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Sp100O35892 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Sp100O35892 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Sp100O35892 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
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Sp100O35892 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Sp100O35892 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sp100O35892 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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