Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 A930006I01Rik-201ENSMUST00000139065 2229 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Ttc39a-202ENSMUST00000106618 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Krt33b-201ENSMUST00000073890 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Smarca5-ps-201ENSMUST00000121843 3123 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ascl4M0QW46 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms