Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Raf1-202ENSMUST00000112949 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Clic5-201ENSMUST00000024755 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Gm20795J3QP49 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms