Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vmn1r34G3XA52 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms