Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acbd5-212ENSMUST00000227663 4566 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms