Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Usf3B2RUQ2 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms