Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Hspa2-201ENSMUST00000080449 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PtprsB0V2N1 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PtprsB0V2N1 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PtprsB0V2N1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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PtprsB0V2N1 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PtprsB0V2N1 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PtprsB0V2N1 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PtprsB0V2N1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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PtprsB0V2N1 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
PtprsB0V2N1 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms