Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Cldn34c4A2ANA3 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Cldn34c4A2ANA3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Cldn34c4A2ANA3 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Cldn34c4A2ANA3 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC8.9□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Rbbp6-202ENSMUST00000071590 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Cldn34c4A2ANA3 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms