Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Lcn6A2AJB9 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Lcn6A2AJB9 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Lcn6A2AJB9 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Lcn6A2AJB9 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Lcn6A2AJB9 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Lcn6A2AJB9 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Lcn6A2AJB9 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Lcn6A2AJB9 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Lcn6A2AJB9 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Lcn6A2AJB9 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Lcn6A2AJB9 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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