Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PdfS4R2K0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PdfS4R2K0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms