Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

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Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt27Q9Z320 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Krt27Q9Z320 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Krt27Q9Z320 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms