Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tulp1Q9Z273 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tulp1Q9Z273 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tulp1Q9Z273 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms