Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfxankQ9Z205 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfxankQ9Z205 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfxankQ9Z205 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfxankQ9Z205 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfxankQ9Z205 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfxankQ9Z205 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RfxankQ9Z205 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RfxankQ9Z205 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RfxankQ9Z205 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms