Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W8

Atp12a, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp12aQ9Z1W8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp12aQ9Z1W8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp12aQ9Z1W8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp12aQ9Z1W8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atp12aQ9Z1W8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp12aQ9Z1W8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp12aQ9Z1W8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp12aQ9Z1W8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp12aQ9Z1W8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp12aQ9Z1W8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp12aQ9Z1W8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atp12aQ9Z1W8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Atp12aQ9Z1W8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atp12aQ9Z1W8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms