Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Ap3b1Q9Z1T1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ap3b1Q9Z1T1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ap3b1Q9Z1T1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms