Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nek4Q9Z1J2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Nek4Q9Z1J2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek4Q9Z1J2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms