Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccl8Q9Z121 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccl8Q9Z121 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms