Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dctn3Q9Z0Y1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Dctn3Q9Z0Y1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms